益生菌是一類對宿主有益的活性微生物，人體、動物體內有益的細菌或真菌主要有：酪酸梭菌、乳酸菌、雙歧桿菌、嗜酸乳桿菌、放線菌、酵母菌等。益生菌是定植于人體腸道、生殖系統內，能產生確切健康功效從而改善宿主微生態平衡、發揮有益作用的活性有益微生物的總稱。人體、動物體內有益的細菌或真菌主要有：酪酸梭菌、乳酸菌、雙歧桿菌、嗜酸乳桿菌、放線菌、酵母菌等。目前世界上研究的功能最強大的產品主要是以上各類微生物組成的復合活性益生菌，其廣泛應用于生物工程、工農業、食品安全以及生命健康領域。

1、益生菌有緩解乳糖不耐癥狀，促進機體營養吸收的作用：益生菌有助于營養物質在腸道內的消化。它能分解乳糖成為乳酸，減輕乳糖不耐癥。雙歧桿菌和乳酸桿菌不僅可以產生各種維生素如維生素B1、B2、B6、B12、煙酸和葉酸等以供機體所需，還能通過抑制某些維生素分解菌來保障維生素的供應。另外，雙岐桿菌還可以降低血氨改善肝臟功能。

2、益生菌有整腸作用，調整微生態失調，防治腹瀉：益生菌活著進入人體腸道內，通過其生長及各種代謝作用促進腸內細菌群的正常化，抑制腸內腐敗物質產生，保持腸道機能的正常。對病毒和細菌性急性腸炎及痢疾，便秘等都有治療及預防作用。益生菌和很多慢性胃炎，消化道潰瘍等消化道疾病有密切的關系。一部分的益生菌能抗胃酸，粘附在胃壁上皮細胞表面，通過其代謝活動抑制幽門螺旋桿菌的生長，預防胃潰瘍的發生。

3、益生菌能代謝產物產生生物拮抗，增強人體免疫力：益生菌可產生有機酸、游離脂肪酸、過氧化氫、細菌素抑制其它有害菌的生長;通過“生物奪氧”使需氧型致病菌大幅度下降，益生菌能夠定殖于粘膜、皮膚等表面或細胞之間形成生物屏障，這些屏障可以阻止病原微生物的定殖，起著占位、爭奪營養、互利共生或拮抗作用。并可以刺激機體的非特異性免疫功能，提高自然殺傷(NK)細胞的活性，增強腸道免疫球蛋白IgA的分泌，改善腸道的屏障功能。

4、益生菌對高血壓的效果：乳酸菌產生的某些物質如γ-氨基丁酸(GABA)具有降低血壓的功效。還有一部分的益生菌能特異分解乳蛋白(酪蛋白)，產生具有抑制引起血壓上升的酶(血管緊張素轉化酶，ACE)活性的多肽(如VPP和LPP)。常期飲用含有這種活性多肽的酸奶有防止高血壓的效果。

5、益生菌有預防陰道感染的作用：不少益生菌有酸化泌尿生殖道的作用。它可以通過降低pH值來抑制有害細菌的生長。還可以通過與有害細菌競爭空間和資源而遏制它們。

6、益生菌有緩解過敏作用：過敏是一種免疫疾病，是人體內免疫功能失調出現不平衡的狀況。有過敏體質的人當外來物質或生物體刺激免疫系統產生免疫球蛋白(IgE)數量過多，使其釋放出一種叫組織胺的物質從而引發過敏癥狀。益生菌療法是目前國內外流行輔助治療過敏的有效方法之一。能利用益生菌調節體內免疫球蛋白(IgE)抗體，達到緩解過敏的免疫療法。

7、益生菌能降低血清膽固醇：可能與其調節和利用內源性代謝產物并且加速短鏈脂肪酸代謝有關。雙歧桿菌、乳桿菌的微生態制劑，服后可使膽固醇轉化為人體不吸收的糞甾醇類物質。從而降低膽固醇水平。

8、益生菌能預防癌癥和抑制腫瘤生長等：乳酸桿菌能提高巨噬細胞的活性，并能防止腫瘤的生長。益生菌可抑制腸道內某些酶的活性，如β-葡糖乙酸酶、β-葡糖醛酸酶、尿素、酶、還原酶、偶氮還原酶等。這些酶可能參與腸道內致癌物的形成。膽鹽經腸道碰到有害菌可能發生解離，就會產生致癌物質，容易引起腸癌。但益生菌可以抑制有害菌，即使有膽鹽的存在，致癌率也大大降低。